Южноафриканские вирусологи сообщили об обнаружении нового штамма коронавируса, который распространяется со скоростью, характерной для наиболее опасных штаммов – «дельта» и «бета» (то есть, индийского и британского). Результаты исследования опубликованы специализированным порталом medRxiv.
Новый штамм получил обозначение C.1.2. В мае на его долю приходилось примерно 2% секвенированных образцов, в июне – 1,6%, а в июле этот показатель составил 2%, сообщается в работе. Эти показатели похожи на те цифры, которые показывали индийский и британский штаммы на раннем этапе их распространения.
Генетики отметили, что новый штамм мутирует в 1,7 раза быстрее, чем все ранее известные штаммы SARS-CoV-2. Согласно полученным при секвенировании его генома данным, в штамме происходит почти 42 мутации в год.
«Такой короткий период ускоренной эволюции по сравнению с общей скоростью вирусной эволюции также характерен для появления штаммов «альфа», «бета» и «гамма», - отмечается в работе.
Авторы исследования отметили, что 52% спайковых мутаций в C.1.2 ранее уже были обнаружены в штаммах «альфа», «бета», «гамма» и «дельта». Часть из их непосредственно связаны с повышенной трансмиссивностью и повышением устойчивости к иммунитету.
C.1.2 – уже второй новый штамм, возникший на территории Южной Африки. В декабре 2020 года в этом же регионе сформировался штамм B.1.351, отличающийся высокой устойчивость к иммунитету, возникшему от перенесенного заболевания и сформированному прививкой AstraZeneca.
По разным оценкам, от 13% до 25% населения ЮАР инфицированы вирусом иммунодефицита человека (ВИЧ). Из-за этого страна превратилась в своего рода инкубатор для инфекционных заболеваний, так как значительная часть населения перманентно имеет очень слабый иммунитет, и возбудитель имеет возможность постоянно циркулировать в обществе, накапливая полезные для себя мутации.
23 августа иммунолог Сай Редди из высшей технической школы Цюриха призвал мировое сообщество готовиться к появлению в следующем году нового штамма коронавируса, который окажется более смертоносным, чем все известные формы SARS-CoV-2. При этом он отмечал, что следующий этап пандемии будет связан с тем, что штаммы «бета» и «гамма» станут еще заразнее, а высоковирулентный штамм «дельта» научится ускользать от иммунитета. Возникновение супервируса, по словам Редди, практически неизбежно: к этому ведут объективные закономерности эволюционного процесса.