Контракт Клементе должен был закончиться в конце декабря, после чего планировалось обсудить вопрос о его продлении еще на два года. Вместо этого сербская федерация приняла решение о досрочном расторжении соглашения. В июле 2006 года Клементе стал первым тренером сборной в истории независимой Сербии.
Перед бывшим тренером сборной Испании ставились две цели - создать молодую и перспективную команду, а также выйти на Евро-2008. В сборную вошли 12 игроков "молодежки", а вот путевку в Австрию и Швейцарию сербы заработать не смогли.
Команда в первой отборочной группе заняла третье место вслед за сборными Польши и Португалии. Все четыре матча со своими главными конкурентами сербы сыграли вничью, но потеряли очки в играх с менее искушенными соперниками. Например, в Казахстане команда Клементе проиграла со счетом 1:2, а в Армении сыграла вничью - 0:0.